江小鱼与江无缺这对命运乖舛的兄弟，识破了邀月、怜星深亘的毒计后，终于手足相认；彼此也有了幸福的婚姻与家庭，安逸的退隐于山林溪涧之间，可是命运总嫉妒著幸福的人们，炙烈的仇火正无情的向他们灼烧，看不见的力量，逼使著这对兄弟的后人，重覆著上一代所犯下的错误…该怎么解开这段纠缠复杂的死结呢？小鱼儿与江无缺究竟与谁成家呢？大侠燕南天、移花宫主又将怎么登场？慕蓉九与黑蜘蛛的另类恋情发展的如何？一连串数不尽的问题，都将在本作中作出合理的交代。看到这里，相信聪明的玩家已经猜出，《新绝代双骄３》将采完全自创的崭新剧本，新的剧本将在原著武侠味道浓厚的剧情里，尝试加入些许的神幻成份，将原先的冒险视野发展得更广。